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Las infecciones intestinales por protozoo continúan siendo un desafío para la salud pública mundial, especialmente en la zona rural. Debido a que el diagnóstico de estos parásitos es difícil, los datos de prevalencia son escasos. Con el objetivo de determinar la prevalencia de la infección por Giardia lamblia y los factores de riesgo asociados a esta infección, se realizó un estudio de corte transversal en una comunidad rural, en la Isla de la Juventud durante el año 2016. La muestra estuvo integrada por 189 habitantes, a los que se realizó un cuestionario semi-estructurado que recogía datos de interés personal y epidemiológico, además muestras de heces. El procesamiento de la información se realizó a través de técnicas computarizadas. La prevalencia de la infección por Giardia lamblia (12.3%) es mayor que la de otros protozoos como Entamoeba histolytica (2.7%), los factores de riesgo asociados a la infección por Giardia lamblia, la asociación más fuerte fue el consumo de agua sin hervir y la posesión de animales afectivos (P<0.05). Existe una prevalencia alta de infección por protozoos intestinales en la comunidad América Labadí. Esto sugiere que la pobre higiene personal y la insalubridad son comportamientos orientados a predisponer la infección por Giardia lamblia.